图: 全基因组挑选以及 NF90/NF110 对 circRNA 表达和病毒免疫功用的调控机制

6 月 15 日,世界闻名学术期刊 Molecular Cell 在线宣布了中国科学院-马普核算生物学研讨所杨力研讨组和中国科学院生物化学与细胞生物学研讨所陈玲玲研讨组对于环形 RNA(circRNA)研讨的最新进展:“Coordinated circRNA biogenesis and function with NF90/NF110 in viral infection”。该研讨经过全基因组挑选发现了一系列与环形 RNA 生成加工等密切遗迹的反式效果蛋白因子,包含与抗病毒免疫遗迹的 NF90 和 NF110 等,提醒其经过联系两边内含子配对序列进而推进环形 RNA 发生的机制,并说明环形 RNA 经过与 NF90/NF110 的竞争性联系在抗病毒免疫过程中表现主要功用效果。

研讨组体系提醒了顺式元件-内含子互补配对序列对环形 RNA 表达的要害效果(Zhang et al., Cell 2014; Zhang et al., Cell Rep 2016);标明不一样顺式内含子互补配对序列的竞争性配对能够致使环形 RNA 的可变反向,进而从一个基因位点发生多个环形 RNA 分子(Zhang et al., Genome Res 2016);经过体系衡量不一样物种中顺式效果元件对环形 RNA 生成的效果,说明晰人基因组中所包含的很多 Alu 序列是环形 RNA 在人中高表达的主要原因之一(Dong et al., RNA Biol 2017)。尽管已有的这些研讨在多个水平体系提醒了顺式内含子互补配对序列对环形 RNA 生成的要害调控效果,可是尽管具有一样的基因组序列,同一位点的环形 RNA 表达在不一样的安排 / 细胞中存在着非常大的区别,这标明还存在反式因子水平的调控效果。一起,尽管已有一些特别环形 RNA 的功用被逐步提醒出来,对大多数环形 RNA 在细胞中的主要功用研讨还缺少体系的研讨,咱们以为与环形 RNA 联系的蛋白因子可能与环形 RNA 的主要生物学功用密切遗迹。

在这项最新的研讨中,科研人员经过全基因组挑选发现了一系列与环形 RNA 生成加工等密切遗迹的反式效果蛋白因子,包含与抗病毒免疫遗迹的 NF90 和 NF110 等,敲低 NF90/NF110 均能够明显下降内源环形 RNA 的表达,其主要经过联系环化外显子两边的内含子配对序列进而推进环形 RNA 的加工。更为主要的是,NF90/NF110 也和成熟的环形 RNA 直接联系构成 circRNP,并在抗病毒过程中表现主要的免疫功用。当病毒感染时,NF90/NF110 出核并致使环形 RNA 表达下降;一起,NF90/NF110 更多地从 circRNP 中被释放出来联系到病毒 mRNA 上,表现抗病毒的效果(如图所示)。研讨还发现,无论是内源存在的环形 RNA、仍是人为构建的环形 RNA 都具有这种联系 NF90/NF110 表现功用的潜力,这标明环形 RNA 参加抗病毒免疫反响的普遍性。

该项研讨在陈玲玲研讨员和杨力研讨员的一起指导下,由生化与细胞所博士研讨生李响、刘楚霄和核算生物学所助理研讨员薛蔚一起完成。该研讨得到生化与细胞所分子生物学技能渠道、细胞剖析技能渠道、化学生物学技能渠道以及核算生物学所生物医学大数据中心多维组学数据渠道的大力支撑,并得到来自科技部、基金委和中科院的经费支撑。

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时间: 2020年02月22日 08:05 | 来源: ^风情*小帅^ | 编辑: 敏元杰 | 阅读: 2563 次

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(敏元杰编辑《^风情*小帅^》2020年02月22日 08:05 )

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